Sintesis Ikatan peptida

Pembentukan ikatan peptida melalui tindak balas dehidrasi

Apabila dua asid amino membentuk dipeptida melalui ikatan peptida, [1] ia adalah sejenis tindak balas pemeluwapan.[2] Dalam jenis pemeluwapan ini, dua asid amino menghampiri satu sama lain, dengan gugusan asid karboksilik rantai bukan sisi (C1) mendekati gugusan amino rantai bukan sisi (N2) yang lain. Salah satu kompaun akan kehilangan hidrogen dan oksigen daripada kumpulan karboksilnya (COOH) dan satu lagi kompaun akan kehilangan hidrogen daripada kumpulan aminonya (NH2). Tindak balas ini menghasilkan molekul air (H2O) dan dua asid amino yang dicantumkan oleh ikatan peptida (−CO−NH−). Kedua-dua asid amino yang bergabung dipanggil dipeptida.

Ikatan amida disintesis apabila kumpulan karboksil satu molekul asid amino bertindak balas dengan kumpulan amino molekul asid amino yang lain, menyebabkan pembebasan molekul air (H2O), oleh itu prosesnya ialah tindak balas sintesis dehidrasi .

Pemeluwapan dehidrasi dua asid amino untuk membentuk ikatan peptida (merah) dengan pengusiran air (biru)

Pembentukan ikatan peptida menggunakan tenaga, terutamanya dalam organisma, diperoleh daripada ATP. [3] Peptida dan protein ialah rantai asid amino yang disatukan oleh ikatan peptida (dan kadangkala oleh beberapa ikatan isopeptida). Organisma menggunakan enzim untuk menghasilkan peptida bukan ribosom, [4] dan ribosom untuk menghasilkan protein melalui tindak balas yang berbeza secara terperinci daripada sintesis dehidrasi di atas.[5]

Sesetengah peptida, seperti alpha-amanitin, dipanggil peptida ribosom kerana ia dibuat oleh ribosom, [6] tetapi kebanyakannya adalah peptida bukan ribosom kerana ia disintesis oleh enzim khusus dan bukannya ribosom. Sebagai contoh, glutathione tripeptida disintesis dalam dua langkah daripada asid amino bebas, oleh dua enzim: ligase glutamat-sistein (membentuk ikatan isopeptida, yang bukan ikatan peptida) dan glutathione synthetase (yang membentuk ikatan peptida). [7] [8]